合肥市原发性肉碱缺乏症新生儿筛查及基因变异分析

doi:10.12372/jcp.2023.22e1344

摘要/Abstract

摘要：

目的分析合肥市新生儿原发性肉碱缺乏症（PCD）的筛查情况及基因变异特征。方法应用串联质谱技术对2016年1月至2021年12月合肥市新生儿疾病筛查中心筛查的631 839份新生儿筛查样本进行检测，初筛阳性者召回新生儿及其母亲进行复筛，复筛结果仍低于临界参考值者，进行高通量二代基因测序。结果共确诊PCD新生儿32例（总体发病率为1/19745）。在32例新生儿中，31例进行高通量测序联合Sanger验证，1例未检出基因变异，30例检出基因变异（男18例、女12例），其中复合杂合变异25例，纯合变异5例，基因确诊率为96.8%。在基因检测阳性30例患儿SLC22A5基因的60个变异中，变异比例最高的为c.1400C>G，占48.3%（29/60），其次为c.51C>G，占15.0%（9/60）。结论合肥市新生儿PCD总体发病率与国内其他地区差异不明显。c.1400C>G和c.51C>G是合肥市新生儿PCD基因变异的常见位点。

关键词: 原发性肉碱缺乏症, 基因变异, 新生儿筛查

Abstract:

Objective To analyze the screening status and genetic variation characteristics of primary carnitine deficiency (PCD) in neonates in Hefei. Methods A total of 631839 newborn screening samples screened by Hefei Neonatal Disease Screening Center from January 2016 to December 2021 were detected by tandem mass spectrometry. Newborns and their mothers with positive initial screening were recalled for re-screening. If the re-screening results were still lower than the critical reference value, high-throughput second-generation gene sequencing was performed. Results A total of 32 neonates were diagnosed with PCD (overall incidence: 1/19745). Among 32 neonates, 31 underwent high-throughput sequencing combined with Sanger validation, 1 had no genetic variation and 30 had genetic variation (18 boys and 12 girls). There were 25 cases of complex heterozygous variation and 5 cases of homozygous variation, and the gene diagnosis rate was 96.8%. Among the 60 variants of SLC22A5 gene in 30 positive children, c.1400C>G had the highest variation ratio, accounting for 48.3% (29/60), followed by c.51C>G, accounting for 15.0% (9/60). Conclusions The overall incidence of neonatal PCD in Hefei was not significantly different from that in other areas of China. c.1400C>G and c.51C>G were the common sites of PCD gene variation in newborns in Hefei City.

Key words: primary carnitine deficiency, genetic variation, newborn screening

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图/表 3

表1

表2

表3

参考文献 14

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年度	活产数	筛查数	筛查率/%	PCD确诊数		PCD检出总数	发病率
年度	活产数	筛查数	筛查率/%	临床+基因确诊	临床确诊	PCD检出总数	发病率
2016年	94 311	78 963	83.7	2	-	2	1/39482
2017年	136 528	130 940	95.9	8	-	8	1/16368
2018年	120 156	115 881	96.4	5	2	7	1/16554
2019年	118 594	116 657	98.4	5	-	5	1/23311
2020年	103 799	102 159	98.4	4	-	4	1/25540
2021年	87 784	87 239	99.4	6	-	6	1/14540
合计	661 172	631 839	95.6	30	2	32	1/19745

编号	性别	初筛血值/ μmol·L^-1	复筛血值/ μmol·L^-1	父源		母源
编号	性别	初筛血值/ μmol·L^-1	复筛血值/ μmol·L^-1	位置	核苷酸变化	位置	核苷酸变化
1	女	8.75	7.60	exon8	c.1400C>G	exon8	c.1400C>G
2	男	6.01	4.01	exon8	c.1400C>G	exon1	c.51C>G
3	女	5.34	4.15	exon1	c.51C>G	exon8	c.1400C>G
4	男	6.29	6.33	exon8	c.1400C>G	exon8	c.1400C>G
5	男	4.26	3.39	exon5	c.845G>A	exon6	c.976_977insAGCAGT
6	女	7.85	3.39	exon1	c.51C>G	exon8	c.1400C>G
7	女	7.16	5.29	exon8	c.1400C>G	exon2	c.428C>T
8	女	2.20	2.20	exon8	c.1400C>G	exon1	c.51C>G
9	男	6.20	6.09	exon8	c.1400C>G	exon2	c.428C>T
10	女	5.25	3.08	exon2	c.428C>T	exon4	c.760C>T
11	男	5.28	5.89	exon4	c.797C>T	exon8	c.1400C>G
12	男	5.86	2.87	exon8	c.1400C>G	exon3	c.505C>T
13	女	8.64	5.35	exon8	c.1400C>G	exon1	c.338G>A
14	男	8.40	5.23	exon7	c.1252C>T	exon8	c.1400C>G
15	男	2.90	2.14	exon1	c.51C>G	exon4	c.760C>T
16	男	6.22	9.30	exon8	c.1400C>G	exon1	c.51C>G
17	女	6.56	5.74	exon4	c.760C>T	exon8	c.1400C>G
18	男	4.87	7.75	exon8	c.1400C>G	exon1	c.51C>G
19	男	5.23	3.87	exon8	c.1400C>G	exon5	c.865C>T
20	男	8.05	5.26	exon8	c.1400C>G	exon8	c.1400C>G
21	男	3.06	2.99	exon7	c.1196G>A	exon5	c.865C>T
22	男	5.73	6.46	exon7	c.1093A>C	exon4	c.679C>A
23	女	6.32	7.47	exon5	c.865C>T	exon8	c.1400C>G
24	女	5.19	4.78	exon8	c.1400C>G	exon7	c.1093A>C
25	男	5.49	4.49	exon8	c.1400C>G	exon4	c.760C>T
26	男	5.27	4.88	exon1	c.51C>G	exon8	c.1400C>G
27	女	5.53	4.06	exon8	c.1400C>G	exon8	c.1400C>G
28	男	8.16	5.92	exon8	c.1400C>G	exon8	c.1400C>G
29	女	3.53	4.23	exon8	c.1400C>G	exon1	c.51C>G
30	男	8.65	6.10	exon7	c.1195C>T	exon4	c.797C>T

分组	例数	初筛C0值	确诊C0值	初筛C0值- 确诊C0值
携带组	24	6.30±1.53	5.33±1.65	1.08 (-0.30~2.18)
不携带组	6	4.14±1.16	3.47±1.52	0.81 (0.10~1.85)
统计量		t=3.21	t=2.49	Z=0.39
P		0.003	0.019	0.695

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